因为双亲要往海外出差，只剩下主角一个人留在日本，于是以一年为期限住在舅父的家里。在他转校到的八十神高中，有一个深夜电视的传言，“在雨夜的12点，看着没有开着的电视上自己的脸，就会浮现另一个人的映像”。主角和同伴在确认深夜电视传言的时候被拉进了异空间，他们随即发现深夜电视跟镇上的连续杀人事件有莫大关系，在那里搜查时被称为暗影的怪物袭击。主角一行人跟怪物接触而觉醒了Persona能力，他们认为警察并不会相信这么离奇的事，便决定独自解决这起连续杀人事件。