经过短暂的和平后，贵族主义在宇宙殖民地的政治界和商界中抬头，当中罗那家族更组成一支私立军队“骨十字先锋军”。地球联邦军一直对宇宙民居采取观察态度，并没有加以理会。U.C.0123年，骨十字先锋军部队突袭Side4各宇宙殖民地，与地球联邦军部队交战。地球联邦军的机动战士的性能不及骨十字先锋军的机动战士，战争处于一一面倒的状态。宇宙殖民地FRONTIERIV的某间大学内正在进行选美比赛，正当裁判宣布西西莉胜出时，一架被毁的机动战士掉下来，会场顿时陷入恐慌。主角西布顿和他的朋友集合后前往战争博物馆避难，但他们眼见地球联邦军节节败退，于是决定驾驶的半毁的旧式机动战士，想逃往24号港口乘搭难民船……