爱德华和艾尔凡斯两兄弟小时候为了令母亲复活，不惜使用禁忌的炼金术“人体炼成”，可惜最后失败告终，更要付出沉重代价──哥哥爱德华失去了左脚、而弟弟艾尔凡斯则整个人消失了，其后爱德华牺牲自己的右手换回弟弟的灵魂，并将其寄附在金属铠甲上。他们为了寻找让身体回复原状的方法和“贤者之石”，踏上紧张刺激的冒险旅程。