宇宙世纪0085年，SIDE3出身的女孩子，雅丝娜.爱尔玛莉特是联邦军MS训练学校的劣等生。毫无乾劲，虽然四周的人都称她「大肉脚」，但在有好感的男孩子──真的鼓励下开始努力，在曾被禁止搭乘的模拟舱的训练上反败为胜，跟其他学生们亦逐渐的变得融洽了。但是，雅丝娜她们所就读的MS训练学校──天空的学校，其实是以极机密的发现、培育新人类为目的而成成立的。以「在实战的极限状况下让新人类觉醒」这样的危险假设下，「委员会」的计划开始进行……？